TCGA数据库的normal样本不够可以拿GTEx来凑
1、GTEx数据库的应用场景 GTEx数据库在生物信息学分析中的应用主要体现在以下几个方面:补充正常组织数据:在使用TCGA等癌症数据库时,有时会遇到正常组织数据不足的情况。例如,卵巢癌、乳腺癌等疾病的正常组样本数量可能较少。
2、因此,GTEx数据库提供了几乎所有转录基因的基因表达数据查询。何时使用GTEx数据库?在使用TCGA数据库时,有时会面临癌症项目中正常组织数据数量较少的问题,例如卵巢癌和乳腺癌等疾病的正常组样本非常少。
3、TCGA:The Cancer Genome Atlas,是一个包含了大量癌症基因组数据的公共数据库。GEPIA2对TCGA数据进行了筛选,虽然具体筛选标准未详细介绍,但确保了数据的准确性和可靠性。
4、正常人数据:GTEx数据库包括的是正常人的数据,可以用于研究正常人不同组织之间的基因表达区别。与TCGA联合使用:由于TCGA重点收集的是癌症组织的数据,对于正常数据的收集相对较少,导致差异表达的结果可能不准确。此时,将GTEx的数据纳入分析,可以提高结果的准确性。
5、数据下载:您可以通过UCSC Xena官网下载TCGA数据库中的胃癌RNA-Seq数据和GTEX数据库中的正常组织RNA-Seq数据。步骤一:下载TCGA数据库中胃癌RNA-Seq数据 访问xenabrowser.net,选择GDC TCGA Stomach Cancer (STAD)数据集,下载包含基因表达矩阵、临床样本信息和生存数据的文件。
6、多组学整合:结合转录组、表观组、蛋白质组数据,挖掘关键调控网络(如WGCNA分析、免疫浸润评估)。非肿瘤方向:心血管疾病、自身免疫病等生信分析竞争较小,易发高分文章。图:m6A甲基化研究热点示例数据来源与工具公共数据库:TCGA(肿瘤)、GEO(非肿瘤)、GTEx(正常组织)、UCSC Xena(多组学整合)。
流行病学筛检问题?
在流行病学研究中,筛检工作至关重要,它能有效识别患者、病例和风险因素。筛检过程中,了解指标如灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、阳性似然比、阴性似然比、Youden指数、漏诊率、误诊率、粗一致率、Kappa值等,能评估筛检效果和准确性。为简化计算,一款Excel工具应运而生,帮助研究人员和医疗人员轻松掌握这些指标。
③利用筛检可以研究疾病的自然史,或开展流行病学监测,例如筛检乙型肝炎表而抗原携带者。这类筛检一般不包含治疗。
题目流行病学调查方法中的筛检,其目的是()A.筛选可疑危险因素,B.探索病因,C.描述疾病三间分布,D.早期发现可疑患者,E.确诊病人,答案是D.早期发现可疑患者。流行病学(epidemiology)是研究特定人群中疾病、健康状况的分布及其决定因素,并研究防治疾病及促进健康的策略和措施的科学。
流行病学:筛检结果与真实状态一致的总比例,公式为(真阳性+真阴性) / 总人数。机器学习:公式为(TP+TN) / (TP+TN+FP+FN)。领域差异与术语混用说明流行病学侧重:关注筛检工具的临床实用性,如灵敏度高可减少漏诊(对病例组友好),特异度高可避免过度医疗(对非病例组友好)。
第五步:回归课本巩固:听课后再次阅读课本,强化基础概念。例如,通过默写“筛检试验的评价指标”检验学习效果。进阶玩法(适合有一定基础者)第一步:制作思维导图:梳理章节逻辑,建立知识框架。例如,以“流行病学研究方法”为中心,延伸出观察法、实验法等分支。
扬州毛老太最终判决结果
1、毛老太因涉嫌妨害传染病防治罪被刑事拘留,而对于其他类似涉及疫情中隐瞒行程、利用特权等行为,需根据具体违法性质和证据依法处理,不能一概而论,特权行为更应彻查并严肃追责。毛老太的处理依据与情况毛老太在南京出现疫情后前往扬州,瞒报南京旅居史,且频繁出入公共场所,发病后还拒绝说出在扬州的行程。
2、岁南京老太毛某宁因涉嫌妨害传染病防治罪被刑拘,其擅自离开封控地、隐瞒行程导致扬州疫情扩散。事件经过7月21日,毛某宁擅自离开已采取封控管理措施的南京居住地,前往扬州姐姐家,未主动报告南京旅居史。
3、过失犯罪的,应当从轻或者减轻处罚。而毛老太未满75周岁,因此不符合从轻或减轻处罚的条件。当然,最终还得由扬州法院依据犯罪情节与认罪态度作出判决。但无论如何,老太太这一辈子,将背着极大地负罪感告终。
4、南京毛老太死刑是肯定不会的,虽然她造成的后果非常严重;但是最终会被判刑是板上钉钉的事了。
《癌度快报》2025年7月3日
1、瑞虎9和瑞虎7都没有突破5000辆以上,尤其是瑞虎9,虽然此前订单一度突破3万辆,但是经过6月份完成月的销售数据来看,瑞虎9的销量为3003辆,与订单量还是有着比较大的差距。
2、贝因美业绩爆雷预盈转实亏收警示函,5年累计亏损超22亿元,毛利率持续下降 7月3日,贝因美(002570.SZ)发布公告称,因业绩快报与业绩预告披露的净利润存在较大差异且由盈转亏,存在相关信息披露不及时、不准确的情形,收到浙江证监局警示函。
3、医疗科技:美国莱斯大学科学家发现利用光刺激分子振动摧毁癌细胞的新方法,对人类黑色素瘤细胞有效性达99%,半数实验鼠经治疗后不再患癌。通信技术:韩国蔚山国立科技大学等团队优化6G通信太赫兹纳米谐振器,将电磁波放大3万倍以上,相关论文发表于《纳米快报》。
4、蒂姆·邓肯是1997年NBA选秀状元,并先后五次获得NBA总冠军,三次获得NBA总MVP。他还是1998年NBA年度最佳新秀,先后获得过两次NBA常规赛MVP。
5、据其发布的5月份产销快报,公司新能源汽车已经连续三个月销量突破10万辆,5月销量达114943辆,同比增长250.44%;1 - 5月累计销量507314辆,同比增长3411%,至此已累计销售超200万辆新能源车型。
为啥北方有症状比例比南方高很多?
1、北方有症状比例比南方高很多的原因就是:我国现在感染的新冠病毒就是BA.2以及BF.7这两种,这两种病毒都为奥密克戎变异毒株BA.5的亚分支。南方和北方的毒株并不是是同一种亚型,病毒的致病率也存在着差异,也就是说,病毒依旧在变异。
2、在国内,从上呼吸道和全身其他症状来看,北方和南方的差异比较明显。有可能是受气候、温度、湿度的影响,比如北方干燥、寒冷,体感症状就会明显重一些,像冬天上呼吸道感染要比夏天症状更明显,会觉得更不舒服。
3、气候因素 大家只要有点常识应该都知道,南方相对于北方来说暖和太多了,而且不像北方那样四季分明,南方地区即使到了冬天也经常需要穿短袖。这气温变化就是造成北方人多发脑中风的一个因素。北方的低温会影响到体内的血管,使血管硬化,对于血压变化的缓存能力下降,就很容易出现血管破裂等情况。
关于铜仁市万山区新增4例集中隔离管控人员阳性情况通报
022年11月9日,铜仁市万山区集中隔离点新增4例新冠肺炎无症状感染者,均为集中隔离管控人员中发现,相关应急处置工作正有序开展。
022年11月10日,铜仁市万山区集中隔离点新增1例核酸检测结果异常人员。具体情况通报如下:感染者信息:无症状感染者10,女,11岁,集中隔离点筛查发现,系11月7日发现无症状感染者1的密接人员。
性别年龄:男,37岁。人员类型:省外返黔人员。检测过程:11月18日核酸检测结果异常,经贵阳市疾病预防控制中心复核结果为阳性。后续处理:立即闭环转运至贵阳市公共卫生救治中心(下坝院区)集中隔离治疗,经省级专家组诊断为新冠肺炎确诊病例(轻型)。
022年11月8日,贵阳市发现4名核酸检测结果异常人员,经复核均诊断为新冠肺炎无症状感染者,相关应急处置工作正有序开展。无症状感染者10性别年龄:女,22岁。发现方式:集中隔离点发现,系11月8日白云区报告确诊病例的密切接触者。
022年9月8日黔南州新增1例新冠肺炎确诊病例(轻型)和2例无症状感染者,相关调查处置情况如下:疫情发现与报告2022年9月8日,黔南州卫生健康局报告贵定县2名隔离管控人员和1名重点区域核酸筛查人员新冠病毒核酸检测结果异常。党委政府高度重视,立即部署应急处置工作。
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本文概览:TCGA数据库的normal样本不够可以拿GTEx来凑 1、GTEx数据库的应用场景 GTEx数据库在生物信息学分析中的应用主要体现在以下几个方面:补充正常组织数据:在使用TC...
文章不错《石家庄阳性样本7例的简单介绍》内容很有帮助